MTsN 5 Pandeglang bermula dari sebuah madrasah swasta yang dikenal dengan nama Madrasah Tsanawiyah Mathla’ul Anwar, yang muncul berkat dukungan dan motivasi besar dari masyarakat sekitar kampung Cening, kampung Kadu Gajah, dan kampung Kadu Heuleut. Melalui kerjasama yang erat antara Masyarakat MTs. Mathla’ul Anwar Cening dan Departemen Agama Kabupaten Pandeglang, sebuah usulan yang gigih dan penuh semangat berhasil terwujud untuk mengubah wajah madrasah tersebut.
Dengan tekad yang bulat dan semangat yang membara, usulan perubahan madrasah itu berhasil direalisasikan. Pada tanggal 25 November 1995, melalui Surat Keputusan (SK) Menteri Agama Republik Indonesia Nomor 515 A Tahun 1995, resmi ditetapkan pembukaan dan penegerian beberapa madrasah, termasuk MTsN Cening.
Sejak saat itu, madrasah yang sebelumnya dikenal sebagai MTs Mathla’ul Anwar berubah identitasnya menjadi MTsN Cening di bawah kepemimpinan Bapak KH. Zainul Arifin. Gedung MTsN Cening pertama hanya memiliki tiga rombel sebagai ruang belajar, dengan sepuluh orang guru. Berlokasi di kecamatan Jiput yang sekarang menjadi kecamatan Cikedal karena pemekaran desa di wilayah tersebut.
Tokoh-tokoh masyarakat yang berperan dalam proses pendirian madrasah ini antara lain:
- Kh. Arkali (Tokoh Pendidikan Mts.Ma)
- Kh. M. Arif (Tokoh Agama)
- Kh. Zainul Arifin (Tokoh Pendidikan)
- Mustopa (Tokoh Masyarakat Cening)
Dalam perjalanannya, madrasah ini telah mengalami beberapa pergantian kepala madrasah, di antaranya:
- Kh. Zaenul Arifin (1995-1998)
- Drs Amiruddin (1998-2003)
- Drs H. Endang (2003-2008)
- Drs H. Ma’mun (2008- Sekitar 2 Bulan)
- Drs Jumhana (2008-2013)
- Amin Hidayat, M.Ag (2013-2014)
- Tati Jumiati, M.Pd (2014- S/D 2018)
- H. Suhardi, S.Pd.I (2018-2020)
- Hj. Neng Eulis, M.Pd.I (2020-2022)
- Achmad Wahyudin, S.Ag. (2022- Sekarang)
Berdasarkan KMA No. 371 Tahun 2015 Tentang Perubahan Nama Madrasah Aliyah Negeri, Madrasah Tsanawiyah Negeri, dan Madrasah Ibtidaiyah Negeri di Provinsi Banten, Madrasah Tsanawiyah Negeri Cening berubah identitasnya menjadi Madrasah Tsanawiyah Negeri 5 Pandeglang Kabupaten Pandeglang Provinsi Banten.
